Deux théories s'affrontent quant à l'origine du nom de la marque. Certains suggèrent qu'elle trouverait son origine au village de San Juan dans la Vuelta Abajo. D'autres avancent que le nom aurait été inspiré par le roman The Bridge of San Luis Rey parut en 1927 aux USA. Dans les faits la marque fut enregistrée en 1938 par deux importateurs anglais (Keyser & Silverstone). En 1960, Silverstone obtint une reconduction de contrat avec les autorités cubaines lui accordant les droits de distribution de la marque pour une période de 30 ans, s'achevant donc en 1990. Entre temps on trouvait notamment en Allemagne une marque distribuée par Habanos sous le nom de San Luis Rey qui disparut en 2000. Aujourd'hui donc Saint Luis Rey est distribué dans le monde entier par Habanos.

Les vitoles de la marque Saint Luis Rey sont en général corsées.